Las dependencias catedralicias, en torno a la cabecera, se disponen de sur a norte: la sacristía de los canónigos, las capillas de los relicarios, la sala capitular y la sacristía de beneficiados.

La sacristía de los canónigos fue adornada en el siglo XVIII con una espléndida decoración de estilo rococó. Los elementos se disponen con simetría y en ellos se aprecia una atinada combinación de las líneas recta y curva. En el muro, hasta la simulada cornisa, se sitúan espejos, reloj, cobres, relicarios, tallas, hornacinas y consolas. Todo ello sobre un fondo decorado en seda, combinando granate y azul, con dibujos de motivos vegetales. Sobre la imposta, el muro se cubre con grandes lienzos en que se representan escenas bíblicas. Son obra de Pedro de Rada en 1762. La fuente del lavabo es de mármol, de formas barrocas.

Las capillas de los relicarios, en el paso a la sala capitular, son dos capillitas con rejas de madera y sendos retablos barrocos. En ellos se guardan los bustos-relicario de plata de San Fermín y San Francisco Javier (siglo XVIII) y los de Santa María Magdalena (siglo XVIII) y Santa Ursula (siglo XVI).

La sala capitular posee sobria decoración arquitectónica rococó y se enriquece con varios lienzos y cobres de los siglos XVII y XVIII.

La sacristía de los beneficiados, o de los capellanes, de arquitectura mucho más sencilla, guarda algunos lienzos, entre ellos una notable Adoración de los Magos, del siglo XVI.